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中藥科技基礎信息數據庫的研究與應用
隨著中醫藥研究的不斷深化,工具書的不斷完善,中藥科技基礎信息數據庫的內容也需不斷維護更新,下面是小編搜集整理的一篇相關論文范文,歡迎閱讀查看。
“中藥科技基礎信息數據庫”的建庫理念是建立可提供結構型、規范性標準化中藥科技基礎數據,支持用戶多用途、多途徑、多層次檢索查詢、中藥數據挖掘的結構型中藥基礎數據庫,為中醫藥科研、臨床、教育、管理、生產開發等各類人員提供中藥單味藥、中藥資源品種、中藥化學成分、中藥藥理、中藥臨床藥理、中藥毒理、炮制品等規范化的基礎數據,可進行關聯查詢的新型檢索工具。
【關鍵詞】 數據庫;中藥科技基礎信息庫;中藥知識挖掘
1 中藥科技基礎信息數據庫的結構
1.1 中藥科技基礎信息數據庫遠程錄入程序
中藥科技基礎信息數據庫目前有8張庫表,即:單味藥、品種、生藥材鑒定、中藥藥理、中藥毒理、中藥臨床藥理、化學成分、炮制品,分別設有:14、17、26、30、18、26、27、14共172個字段。每張庫表即可成為一個獨立的個體,又與各表間有著一定的內在關聯,使之成為一個有機的整體。
中藥科技基礎信息數據庫結構以“單味藥”為主表,二級表有:品種、生藥材鑒定、中藥藥理、中藥毒理、中藥臨床藥理、化學成分、炮制品。
該庫遠程編輯加工的界面能夠在很大程度上組織起一個中醫藥信息系統,容納了中草藥中的大量知識。該系統設計了遠程錄入程序botany,這個程序采用了不同的數據庫結構,具有較強的容錯性,提供數據的遠程錄入和維護、多用戶分級分權限管理、表查詢字段管理、人員錄入工作量統計等功能。
1.1.1 標準表的建立
在中醫藥數據中,存在著一些專用的標準詞匯,對這些詞匯的引用和管理一直以來沒有很好的技術支持。為此,該系統設計開發了標準表管理程序,提供了對標準數據的統一管理和規劃。其功能包括標準表的創建,標準表的刪除以及對標準表數據的添加、刪除、修改以及向標準表中批量導入輸入。
基于中藥科技基礎信息數據庫的結構數據關系我們建立了33張標準表,標準表的設立引導了與關聯數據項的關聯。見表1。表1 中藥科技基礎信息庫的標準表(略)
1.1.2 數據來源
以“中藥數據庫”為基礎數據,以權威工具書《中華本草》、《中華人民共和國藥典》、《中國常用中藥材》、《中國藥材學》、《中藥現代研究與臨床應用》、《現代中藥栽培養植與加工手冊》、《常用中藥成分與藥理手冊》、《植物活性成分辭典》、《天然活性成分簡明手冊》、《中藥炮制學》以及普通高等教育中醫藥類規劃教材為數據依據。
1.1.3 質量控制
該課題組先后制定了“中藥基礎庫界面編輯標準”、“中藥基礎庫操作手冊”、“中藥藥理補充說明”、“中毒理及中藥臨床藥理樣本”、“中藥炮制學說明”、“中藥炮制學加工工藝標準”,為數據制作奠定了基礎。
中藥科技基礎信息庫的完成數據量:單味藥11 013條、化學成分5 944條、品種8 199條、生藥材鑒定4 350條、中藥藥理5 407條、中藥臨床藥理632條、中藥毒理1 160條、炮制品375條,總計37 080條。
1.2 中藥科技基礎信息數據庫導入程序
本系統為面對管理人員的管理系統(Magic)。目前支持導入遠程錄入的有8張表:“單味藥、化學成分、品種、生藥材鑒定、一般藥理、一般臨床藥理、一般毒理、炮制品”。登陸以后進入主界面,選擇需要導入的表,就進入相應表的導入界面。每個表的導入界面都是一樣的:最上面是一些篩選條件,用來選擇需要導入的記錄;中間是將要導入的記錄,為了簡單起見(遠程界面提供添加、修改、刪除全套功能),只顯示了1個ID、1個相關字段(如中藥名稱等)和一些附加信息(錄入人員、狀態標志等);最下面是記錄導入的統計和控制。在導入時要先填入篩選條件,然后點擊統計生成要導入的記錄集,才能進行數據的導入。
此外,Magic附帶了統計錄入人員工作量的功能,在主界面點擊統計工作量即可。
1.3中藥科技基礎信息數據庫導航系統
中藥科技基礎信息數據庫的導航系統包含了幾十張大型復雜的數據表,其拓撲結構之復雜、數據格式的多樣化以及表與表之間的關系紛繁錯雜是中醫藥學科固有的特性。為了能實現這些表數據之間的導航,設計了BaseView網頁導航系統。該系統將錯綜復雜的表結構及其關系通過網頁聯接起來,實現了數據相關性的良好導航。
該導航系統查詢是以查詢類別對應相應的查詢內容的導航系統,可以進行精確與模糊兩種查詢。查詢類別設有“單味藥、品種、炮制品、藥理作用、化學成分”。查詢單味藥主表可直接查詢到11個相關聯關系。
從查詢類別五大板塊查詢,可查詢與五大板塊相對應的每個主題的關系項,如“單味藥”對應本庫表14項與之關聯的內容。以此類推,“品種”對應本庫表17項、“炮制品”對應本庫表14項、“中藥藥理”對應本庫表30項、“中藥化學成分”對應本庫表27項,這樣查詢點共有102個。與102個查詢點相關聯的庫表可進行系列關聯查詢。
2 中藥科技基礎信息數據庫的應用及歸類
2.1 中藥科技基礎信息數據庫的應用
以“紅花”為例,按“單味藥”查詢,選擇后在相應中藥名稱處填“紅花”,查詢結果見表2。表2 以“紅花”為例查詢所得結果(略)
“中藥科技基礎信息數據庫”關聯查詢以紅花為例:從該表進入查詢類別,可以按“單味藥、品種、炮制品、藥理作用、化學成分”查詢?傻玫脚c“紅花”單味藥的數據相關聯的其他數據,如品種、藥理、毒理、臨床藥理、功效、歸經、性味、疾病、化學成分、配伍、炮制品等11種關聯數據,并可進一步深入關聯。見表3。這時我們得到該藥的品種數據并與之相關的生藥材鑒定方法、該品種的單味藥、該品種的科屬類別。以生藥材鑒別為例,見表4。表3 以“紅花”為例進一步深入關聯查詢結果(略)表4 “紅花”生藥材鑒別查詢(略)
通過查詢我們了解到紅花藥材的一系列信息,如果進入“藥理”表或“臨床藥理”表,又會從另一點而展開,最終又回到基點上,即由點到面,由面到點多重關聯的查詢,充分體現了中藥科技基礎信息的特性。
2.2 中藥科技基礎信息數據庫的歸類查詢
中藥科技基礎信息庫單味藥歸類項;化學成分、疾病、功效、性味、歸經、品種,化學成分歸類項:功效、單位藥。
以單味藥大黃的性味歸類為例,從“單味藥”進入精確查詢,然后進入“大黃”相關聯的“該性味的單味藥”,得到:“苦”、“寒”中藥藥性。查詢順序是:單味藥:大黃,精確查詢-查詢詳情-性味:大黃-該單味藥的性味:苦、寒。我們再以性味“苦”為例,點擊“苦”,再連續進入具備該性味的“單味藥”,得到具有性味“苦”的單味藥有4 275條,如芙蓉麻、芙蓉菊根、扶栘木皮、扶桑金星蕨、。扶芳藤、伏;ā⒎鹗指谈、鳳仙透骨草、鳳仙根、鳳仙、鳳尾豬鬃草、鳳尾搜山虎、鳳凰毛、縫線石楠、蜂窩草、蜂斗菜、楓香樹根、楓柳皮、風箱樹葉、風箱樹花、風箱樹根、風花菜、豐滿鳳仙花、豐花草、糞箕篤、粉團花、粉萍婆、粉綠藤、粉苞苣、分心木、肺形草、榧花、肥豬苗、肥肉草、非洲戴星草、飛天蠄蟧、飛來藍、飛海蛾、飛蛾樹、防風草、滇雞骨常山、毛貫眾等。
按其歸類項查詢,還可根據需求對其單味藥的其他歸類項進行歸類,為中藥的知識挖掘提供了一個強大的中藥科技基礎信息數據平臺。
3 中藥科技基礎信息數據庫維護與完善
隨著中醫藥研究的不斷深化,工具書的不斷完善,中藥科技基礎信息數據庫的內容也需不斷維護、更新、充實。其中一些數據需進行結構化處理,如“生藥材鑒定”中的:“藥材鑒別、理化鑒別、顯微鑒別、色譜鑒別、光譜鑒別”等字段,“品種”表中的“藥材栽培”這部分數據的結構化目前也具備了一定的條件。中藥科技基礎信息數據庫“生藥材鑒定”、“品種”表,若進一步結構化后,對于中藥材科研及生產以及市場需求,可提供有效的基礎信息。在不斷的優化進程中,統計功能也將得到完善。
4 結語
中藥科技基礎信息數據庫依托在一個功能極其強大的Oracle9I數據庫系統平臺上,它具有較強的關聯查詢功能。中藥基礎數據庫超越了單類別工具書的局限性,也摒除了單表型中藥數據庫的單一性,它綜合了中藥學相關學科的特性,組成了一個強大的中藥學體系,即宏觀,又微觀,具有任意、快捷、獲取最有效規范化標準的基礎數據的優勢。
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