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  • 公衛(wèi)助理醫(yī)師《生物化學(xué)》蛋白質(zhì)的化學(xué)知識

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    2017年公衛(wèi)助理醫(yī)師《生物化學(xué)》蛋白質(zhì)的化學(xué)知識

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    2017年公衛(wèi)助理醫(yī)師《生物化學(xué)》蛋白質(zhì)的化學(xué)知識

      第一節(jié) 蛋白質(zhì)的分子組成

      一、蛋白質(zhì)的元素組成

      主要有 C、H、O、N、S。

      各種蛋白質(zhì)的含氮量很接近,平均為16%。

      二、蛋白質(zhì)的基本組成單位——氨基酸

      蛋白質(zhì)在酸、堿或蛋白酶的作用下,最終水解為游離氨基酸(amino acid),即蛋白質(zhì)組成單體或構(gòu)件分子。存在于自然界中的氨基酸有300余種,但合成蛋白質(zhì)的氨基酸僅20種(稱編碼氨基酸)。

      (一)氨基酸的結(jié)構(gòu)通式

      組成蛋白質(zhì)的20種氨基酸有共同的結(jié)構(gòu)特點(diǎn):

      1.氨基連接在α- C上,屬于α-氨基酸(脯氨酸為α-亞氨基酸)。

      2.R是側(cè)鏈,除甘氨酸外都含手性C,有D-型和L-型兩種立體異構(gòu)體。天然蛋白質(zhì)中的氨基酸都是L-型。

      (二)氨基酸的分類

      1.按R基的化學(xué)結(jié)構(gòu)分為脂肪族、芳香族、雜環(huán)、雜環(huán)亞氨基酸四類。

      2.按R基的極性和在中性溶液的解離狀態(tài)分為非極性氨基酸、極性不帶電荷、極性帶負(fù)電荷或帶正電荷的四類。

      帶有非極性R(烴基、甲硫基、吲哚環(huán)等,共9種):甘(Gly)、丙(Ala)、纈(Val)、亮(Leu)、異亮(Ile)、苯丙(Phe)、甲硫(Met)、脯(Pro)、色(Trp)

      帶有不可解離的極性R(羥基、巰基、酰胺基等,共6種):絲(Ser)、蘇(Thr)、天胺(Asn)、谷胺(Gln)、酪(Tyr)、半(Cys)

      帶有可解離的極性R基(共5種):天(Asp)、谷(Glu)、賴(Lys)、精(Arg)、組(His),前兩個為酸性氨基酸,后三個是堿性氨基酸。

      (三)氨基酸的重要理化性質(zhì)

      1.一般物理性質(zhì)

      α-氨基酸為無色晶體,熔點(diǎn)一般在200 oC以上。各種氨基酸在水中的溶解度差別很大(酪氨酸不溶于水)。一般溶解于稀酸或稀堿,但不能溶解于有機(jī)溶劑,通常酒精能把氨基酸從其溶液中沉淀析出。

      芳香族氨基酸(Tyr、Trp、Phe)有共軛雙鍵,在近紫外區(qū)有光吸收能力,Tyr、Trp的吸收峰在280nm,Phe在265 nm。由于大多數(shù)蛋白質(zhì)含Tyr、Trp殘基,所以測定蛋白質(zhì)溶液280nm的光吸收值,是分析溶液中蛋白質(zhì)含量的快速簡便的方法。

      2.兩性解離和等電點(diǎn)(isoelectric point, pI)

      氨基酸在水溶液或晶體狀態(tài)時以兩性離子的形式存在,既可作為酸,又可作為堿起作用,是兩性電解質(zhì),其解離度與溶液的pH有關(guān)。

      在某一pH的溶液中,氨基酸解離成陽離子和陰離子的趨勢和程度相等,成為兼性離子,呈電中性,

      此時溶液的pH稱為該氨基酸的等電點(diǎn)。

      3.氨基酸的'化學(xué)反應(yīng)

      氨基酸的化學(xué)反應(yīng)是其基團(tuán)的特征性反應(yīng)。

      (1)茚三酮反應(yīng)

      所有具有自由α-氨基的氨基酸與過量茚三酮共熱形成藍(lán)紫色化合物。

      (2)與2,4-二硝基氟苯(DNFB)的反應(yīng)

      三、肽(peptide)

      1.肽鍵與肽鏈

      一個氨基酸的α-羧基和另一個氨基酸的α-氨基脫水形成的酰胺鍵稱為肽鍵。多肽鏈的方向性是從N末端指向C末端。

      肽分子中不完整的氨基酸稱為氨基酸殘基。肽按其序列從N端到C端命名。一般10肽以下屬寡肽,10肽以上為多肽。

      2.生物活性肽

      谷胱甘肽(glutathione,GSH)

      是由Glu、Cys、Gly組成的一種三肽,又叫γ-谷氨酰半胱氨酰甘氨酸(含γ-肽鍵)。

      第二節(jié) 蛋白質(zhì)的分子結(jié)構(gòu)

      一、蛋白質(zhì)的一級結(jié)構(gòu)(primary structure)

      蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)是空間結(jié)構(gòu)和特異生物學(xué)功能的基礎(chǔ)。

      二、蛋白質(zhì)的二級結(jié)構(gòu)(secondary structure)

      蛋白質(zhì)的二級結(jié)構(gòu)是指其分子中主鏈原子的局部空間排列,是主鏈構(gòu)象(不包括側(cè)鏈R基團(tuán))。

      兩種主鏈原子的局部空間排列的分子模型(α-螺旋)和(β-折疊)。

      1.肽單位

      肽鍵及其兩端的α-C共6個原子處于同一平面上,組成了肽單位(所在的平面稱肽鍵平面)。

      肽鍵C—N鍵長為0.132nm,比相鄰的單鍵(0.147nm)短,而較C=N雙鍵(0.128nm)長,有部分雙鍵的性質(zhì),不能自由旋轉(zhuǎn)。肽鍵平面上各原子呈順反異構(gòu)關(guān)系,肽鍵平面上的`O、H以及2個α-碳原子為反式構(gòu)型(transconfiguration)。

      2.α-螺旋

      α-螺旋是肽鍵平面通過α-碳原子的相對旋轉(zhuǎn)形成的一種緊密螺旋盤繞,是有周期的一種主鏈構(gòu)象。其特點(diǎn)是:

      ② 螺旋每轉(zhuǎn)一圈上升3.6個氨基酸殘基,螺距約0.54nm

      ②相鄰的螺圈之間形成鏈內(nèi)氫鍵,氫鍵的取向幾乎與中心軸平行。

      ③螺旋的走向絕大部分是右手螺旋,殘基側(cè)鏈伸向外側(cè)。R基團(tuán)的大小、荷電狀態(tài)及形狀均對α-螺旋的形成及穩(wěn)定有影響。

      3.β-折疊

      ① 相鄰肽鍵平面間折疊成110度角,呈鋸齒狀。

      ② 兩個以上具β-折疊的肽鏈或同一肽鏈內(nèi)不同肽段相互平行排列,形成β-折疊片層,其穩(wěn)定因素是肽鏈間的氫鍵。

      ③ 逆向平行的片層結(jié)構(gòu)比順向平行的穩(wěn)定。

      α-螺旋和β-折疊是蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)的主要形式。

      4.β-轉(zhuǎn)角

      5.不規(guī)卷曲

      6.超二級結(jié)構(gòu)和結(jié)構(gòu)域

      三、蛋白質(zhì)的三級結(jié)構(gòu)(tertiary structure)

      指一條多肽鏈中所有原子的整體排布,包括主鏈和側(cè)鏈。維系三級結(jié)構(gòu)的作用力主要是次級鍵(疏水相互作用、靜電力、氫鍵等)。在序列中相隔較遠(yuǎn)的氨基酸疏水側(cè)鏈相互靠近,結(jié)合蛋白質(zhì)的輔基往往鑲嵌其內(nèi),形成功能活性部位,而親水基團(tuán)則在外,這也是球狀蛋白質(zhì)易溶于水的原因。

      四、蛋白質(zhì)的四級結(jié)構(gòu) (quaternary structure)

      有些蛋白質(zhì)的分子量很大,由2條或2條以上具有獨(dú)立三級結(jié)構(gòu)的多肽鏈通過非共價鍵相互結(jié)合而成,稱為蛋白質(zhì)的四級結(jié)構(gòu)。構(gòu)成四級結(jié)構(gòu)的每條多肽鏈稱為亞基 (subunit),亞基單獨(dú)存在時一般沒有生物學(xué)功能,構(gòu)成四級結(jié)構(gòu)的幾個亞基可以相同或不同。如血紅蛋白(hemoglobin,Hb) 是由兩個α-亞基和兩個β-亞基形成的四聚體。

      五、蛋白質(zhì)分子中的化學(xué)鍵

      蛋白質(zhì)的一級結(jié)構(gòu)是由共價鍵形成的,如肽鍵和二硫鍵。而維持空間構(gòu)象穩(wěn)定的是非共價的次級鍵。如氫鍵、鹽鍵、疏水鍵、范德華引力等。

      第三節(jié) 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系

      一、蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系

      (一)一級結(jié)構(gòu)是空間構(gòu)象的.基礎(chǔ)

      如果一級結(jié)構(gòu)未破壞,保持了氨基酸的排列順序就可能回復(fù)到原來的三級結(jié)構(gòu),功能依然存在。

      (二)種屬差異

      (三)分子病

      鐮刀狀紅細(xì)胞貧血病。

      二、蛋白質(zhì)空間結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系

      蛋白質(zhì)的空間結(jié)構(gòu)是其生物活性的基礎(chǔ),空間結(jié)構(gòu)變化,其功能也隨之改變。

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      第四節(jié) 蛋白質(zhì)的理化性質(zhì)

      蛋白質(zhì)的理化性質(zhì)和氨基酸相似,有兩性解離及等電點(diǎn)、紫外吸收和呈色反應(yīng)。還有膠體性質(zhì)、沉淀、變性和凝固等特點(diǎn)。

      一、蛋白質(zhì)的高分子性質(zhì)

      蛋白質(zhì)的水溶液具有親水膠體的性質(zhì)。顆粒表面的水化膜和電荷是其穩(wěn)定的因素,調(diào)節(jié)pH至pI、加入脫水劑等,蛋白質(zhì)即可從溶液中沉淀出來。

      透析法是利用蛋白質(zhì)不能透過半透膜的性質(zhì),去掉小分子物質(zhì),達(dá)到純化的目的。

      大小不同的蛋白質(zhì)分子可以通過凝膠過濾分開。又稱分子篩層析。

      二、蛋白質(zhì)的兩性解離

      蛋白質(zhì)和氨基酸一樣是兩性電解質(zhì),在溶液中的荷電狀態(tài)受pH值影響。當(dāng)?shù)鞍踪|(zhì)溶液處于某一pH時,蛋白質(zhì)解離成正、負(fù)離子的趨勢相等,即成為兼性離子,凈電荷為零,此時溶液的pH稱為該蛋白質(zhì)的等電點(diǎn)。pH>pI時,該蛋白質(zhì)顆粒帶負(fù)電荷,反之則帶正電荷。在人體體液中多數(shù)蛋白質(zhì)的等電點(diǎn)接近pH5,所以在生理pH7.4環(huán)境下,多數(shù)蛋白質(zhì)解離成陰離子。少量蛋白質(zhì),如魚精蛋白、組蛋白的.pI偏于堿性,稱堿性蛋白質(zhì),而胃蛋白酶和絲蛋白為酸性蛋白。

      三、蛋白質(zhì)的變性、沉淀和凝固

      蛋白質(zhì)在某些理化因素的作用下,空間結(jié)構(gòu)被破壞,導(dǎo)致理化性質(zhì)改變,生物學(xué)活性喪失,稱為蛋白質(zhì)的變性(denaturation)。

      蛋白質(zhì)變性的本質(zhì)是多肽鏈從卷曲到伸展的過程,不涉及一級結(jié)構(gòu)的改變。變性作用不過于劇烈,是一種可逆反應(yīng),去除變性因素,有些蛋白質(zhì)原有的構(gòu)象和功能可恢復(fù)或部分恢復(fù),稱為復(fù)性(denaturation)。

      蛋白質(zhì)變性的主要表現(xiàn)是失去生物學(xué)活性,變性蛋白溶解度降低,易形成沉淀析出;易被蛋白水解酶消化。

      蛋白質(zhì)自溶液中析出的現(xiàn)象,稱為蛋白質(zhì)的沉淀。鹽析、有機(jī)溶劑、重金屬鹽、生物堿試劑都可沉淀蛋白質(zhì)。鹽析沉淀蛋白質(zhì)不變性,是分離制備蛋白質(zhì)的常用方法。如血漿中的清蛋白在飽和的硫酸銨溶液中可沉淀,而球蛋白則在半飽和硫酸銨溶液中發(fā)生沉淀。乙醇、丙酮均為脫水劑,可破壞水化膜,降低水的介電常數(shù),使蛋白質(zhì)的解離程度降低,表面電荷減少,從而使蛋白質(zhì)沉淀析出。低溫時,用丙酮沉淀蛋白質(zhì),可保留原有的生物學(xué)活性。但用乙醇,時間較長則會導(dǎo)致變性。重金屬鹽(Hg2+、Cu2+、Ag+),生物堿與蛋白質(zhì)結(jié)合成鹽而沉淀,是不可逆的。

      凝固是蛋白質(zhì)變性發(fā)展的不可逆的結(jié)果。沉淀的蛋白質(zhì)不一定變性(如鹽析)。

      四、蛋白質(zhì)的紫外吸收和呈色反應(yīng)

      蛋白質(zhì)含芳香族氨基酸,在280nm波長處有特征性吸收峰。

      例題:

      1.測得某一蛋白質(zhì)樣品的氮含量為0.40g,此樣品約含蛋白質(zhì)多少?

      A.2.00g  B.2.50g  C.6.40g  D.3.00g   E.6.25g

      2.下列含有兩個羧基的氨基酸是:

      A.精氨酸 B.賴氨酸 C.甘氨酸  D.色氨酸  E.谷氨酸

      3.維持蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)的主要化學(xué)鍵是:

      A.鹽鍵  B.疏水鍵  C.肽鍵   D.氫鍵    E.二硫鍵

      參考答案

      1.B 2.E 3.D

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